Можно ли регистрировать религиозную организацию по домашнему адресу пастора?

Да. По Гражданскому кодексу РФ государственная регистрация юридического лица осуществляется по местонахождению его постоянно действующего исполнительного органа. Если такого органа нет, то иного органа или лица, которые имеют право действовать от имени юридического лица без доверенности. Пастор является лицом, который имеет право действовать от имени юридического лица без доверенности.

Если вам нужно обосновать это право, то надо ссылаться на жилищное законодательство. В нем нет запрета на использование жилых помещений в качестве местонахождения организации. Статья 17 Жилищного кодекса РФ устанавливает, что не допускается размещение в жилых помещениях лишь промышленных производств. При этом гражданин вправе использовать свое жилье для проведения религиозных обрядов (Ст. 16 п. 2 Федерального Закона «О свободе совести и о религиозных объединениях» №125-ФЗ от 26 сентября 1997 г.).